根據(jù)《高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定管理辦法》第十九條等相關(guān)規(guī)定，企業(yè)在以下情況下會被取消高新技術(shù)企業(yè)資格：

1、申請認(rèn)定過程存在嚴(yán)重問題

弄虛作假：在申請認(rèn)定過程中，存在資料、財務(wù)數(shù)據(jù)、相關(guān)文件等嚴(yán)重造假行為，如虛構(gòu)知識產(chǎn)權(quán)、編造研發(fā)費用投入、虛報科技人員情況等。

2、企業(yè)經(jīng)營與管理出現(xiàn)重大問題

重大安全、質(zhì)量事故或嚴(yán)重環(huán)境違法：發(fā)生重大安全事故、重大質(zhì)量事故或有嚴(yán)重環(huán)境違法行為，對社會造成嚴(yán)重不良影響。

未按期報告重大變化或未填報報表：未按期報告與認(rèn)定條件有關(guān)的重大變化情況，如企業(yè)經(jīng)營業(yè)務(wù)發(fā)生重大變更、核心技術(shù)人員大量流失等;或者累計兩年未填報年度發(fā)展情況報表。

3、核心指標(biāo)不達(dá)標(biāo)

高新技術(shù)產(chǎn)品（服務(wù)）收入占比不達(dá)標(biāo)：企業(yè)的高新技術(shù)產(chǎn)品(服務(wù))收入占總收入的比重達(dá)不到規(guī)定要求，如一年中該比重達(dá)不到 60% 。

研發(fā)費用占比不符合要求：最近三年的研發(fā)費用總額度與同期銷售收入總額的比例不符合相關(guān)規(guī)定。

科研人員占比不符合條件：企業(yè)內(nèi)部科研人員占比造假或?qū)嶋H占比不符合高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定條件。

4、知識產(chǎn)權(quán)方面存在問題

知識產(chǎn)權(quán)造假或無效：企業(yè)的知識產(chǎn)權(quán)存在造假情況，如偽造專利證書、虛構(gòu)軟件著作權(quán)等;或者企業(yè)原有的知識產(chǎn)權(quán)被宣告無效，導(dǎo)致企業(yè)不符合知識產(chǎn)權(quán)方面的認(rèn)定條件。

知識產(chǎn)權(quán)侵權(quán)糾紛：企業(yè)的知識產(chǎn)權(quán)存在侵權(quán)糾紛，且經(jīng)司法或行政程序認(rèn)定侵權(quán)成立，影響企業(yè)核心自主知識產(chǎn)權(quán)的有效性和合法性。

5、財務(wù)管理與稅務(wù)問題

財務(wù)管理不規(guī)范：企業(yè)季報、年報填寫的數(shù)據(jù)不符合高新技術(shù)企業(yè)體系要求，存在財務(wù)管理混亂、賬目不清等問題，如研發(fā)費用核算不準(zhǔn)確、未建立研發(fā)費用專賬管理或?qū)Ｙ~管理不達(dá)標(biāo)等。

偷稅漏稅行為：企業(yè)存在偷稅漏稅等違反稅收法律法規(guī)的行為，稅務(wù)機(jī)關(guān)在稅務(wù)檢查中發(fā)現(xiàn)企業(yè)存在重大稅務(wù)問題。